“今日热文:北京新发地疫情病毒源头最新结论”

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据清华大学结构生物学高精尖创新中心微信公众平台报道，去年6月11日，突然出现1例新型冠状病毒感染患者，在北京连续56天打破了无新病例的平静。 这个患者(指示病例)很快得到了治疗，病情也很快得到了控制，但到底是从哪里感染的病毒还是个谜。

为了进一步明确新发生的疫情的病毒来源，多个机构共同攻克了难关。 年10月23日，清华大学、北京市疾病预防控制中心、中国医学科学院病原生物学研究所、北京大学、中国科学院北京基因组研究所的研究人员在《国家科学评论》( national science review )线上表示， 可能来源于冷链食品污染( Cold-Chainfoodcontaminationasthepossibleoriginofcovid-19 Resurgence in Beijing )的研究论文) academic.oup / 通过对环境和食品等样品的核酸测序和病毒基因组序列分析，结合全面的流行病学调查和大数据观察，明确了此次疫情可能来源于冷链食品污染，提出了冷链运输可能是新型冠状病毒传递的新途径。

对指示病例的流行病学调查和大数据观察进行比较后，通过现场和接触者的检查，发现来自北京新发地市场的2个环境样本呈新型冠状病毒核酸阳性。 随后，对该市场的538名员工扩大了病毒核酸筛查，又发现45人呈阳性。 新发地市场很快成为关注的焦点，北京市有关部门采取了果断的关闭措施，有力地阻止了疫情的蔓延。 6月15日，北京市开始全市核酸筛查。 通过对1000多万人口和5000多名环境样本的检测，共发现368名新型冠状病毒核酸阳性。 所有这些感染者都与新发地市场直接或间接相关。 其中169人是新发地市场的员工，103人在5月30日至6月12日期间去过新发地市场，剩下96人平均是这些人的接触者。 没有发现独立于该市场的早期传递链或独立传递链，表明新发地市场是此次疫情爆发的单一源头。

结合新发病地市场流行病学调查，研究人员初步查明综合交易大厅地下一层(牛羊肉厅)水产区s14号展台可能是感染的源头。 s14号展位的7名工作人员均为新冠确诊病例，症状出现时间较快。 在根据流行病学模型推算的疫情开始流行时间范围内，5位客户新冠抗体检测阳性，其5位客户到访了s14号展位。 这5名顾客及其密切接触者在过去14天中，没有到过中高风险区域，也没有接触过来自中高风险区域的人，进一步暗示了疫情是从新发地市场传到外部的。

研究小组还利用自主研发的低病毒量样本解决方法，对110例病例和环境样本进行了高通量核酸序列分析，共获得72条优质新型冠状病毒基因组序列。 通过分解，这些序列都有8个特征变异位点( c241t、c3037t、c14408t、a23403g克、ggg28881-28883aac和c6026t ) )，这些位点在中国迄今为止的本土和输入病例中均有发现。 与新型冠状病毒基因序列数据库比较，发现除c6026t外，拥有7个变异位点的病毒在欧洲最多。 这些结果进一步表明，新发地疫病的病毒是单一性的新发地外输入。

综合上述结果，确认s14展位的工作人员未涉及新型冠状病毒感染者的嫌疑和确诊，5月至6月初期在北京也未报告新的感染病例，提示病毒很可能来源于国外的进口。 进一步调查显示，在s14号展位销售的三文鱼中，冷冻三文鱼是唯一来自海外的商品，摊主于5月30日从某供应商( x企业)进口，收购包装齐全的三文鱼，在市场上切割解决后零售 为此，对新发地市场内所有三文鱼供应商的冷库进行了样品检测，发现x企业5份鱼体短吻鳄样品为新型冠状病毒核酸阳性，其中未开封鱼体短吻鳄样品中顺序检测得到的病毒基因组序列为本次疫情中人类和环境样品中的病毒基因组序列

由于无法从鱼体中分离得到活病毒，因此无法说明鱼体病毒的活力。 但通过优质病毒基因组序列特征的分解和流行病学调查相结合，表明来自国外疫情高发地区的冷链进口食品很可能成为此次新发地疫情的病毒源头。 在本文发表的过程中，中国疾控中心报道了从青岛获得的冷链食品中分离新型冠状病毒，并暗示冷链食品可能是新型冠状病毒传递的重要渠道。 本研究为明确北京新型冠状病毒感染源提供了重要证据，为优化疫情常态化防控策略提供了重要依据。

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